Ambientata inizialmente tra Fargo, nel Dakota del Nord, e Luverne, in Minnesota, nel mese di marzo del 1979, la seconda stagione è un prequel della prima, che dettaglia gli eventi che hanno portato al massacro in Sioux Falls, nel Dakota del Sud. Racconta la storia dell'estetista Peggy Blumquist (Dunst) e di suo marito il macellaio Ed Blumquist (Plemons), che coprono l'omicidio compiuto da Rye Gerhardt, figlio di Floyd Gerhardt (Smart), matriarca della famiglia criminale Gerhardt di Fargo. Nel frattempo, Lou Solverson (Wilson), poliziotto ed ex-militare della guerra in Vietnam, e lo sceriffo di Rock County Hank Larsson (Danson) indagano su tre omicidi compiuti da Rye Gerhardt.