Una gigantesca nuvola aliena di enorme potenza, dopo aver distrutto tre incrociatori klingon, entra nello spazio della Federazione neutralizzando ogni cosa lungo il suo cammino. Mentre si dirige verso la Terra, l’Ammiraglio James T. Kirk riprende il comando di un’U.S.S. Enterprise rimessa a nuovo e si muove per affrontare l’aggressore.