La morte di Don Pietro Savastano ha lasciato di nuovo un vuoto di potere; Ciro Di Marzio, distrutto dalla morte della figlia, sembra essere senza prospettive; Genny Savastano è diviso tra Roma, dove ha una moglie e un figlio, e la terra natia. Anche le due donne protagoniste della seconda stagione sembrano non avere prospettive: dopo la morte di Don Pietro, Patrizia è senza un compagno e senza un obiettivo, e Scianel, privata del figlio, è in prigione. Ma Gomorra è pronta a riorganizzarsi, entreranno in scena nuovi personaggi come Enzo e Valerio, ma sia Ciro che Genny non lasceranno spazio così facilmente alle nuove leve scalpitanti.