2 Ottobre 1988. Donnie Darko è un giovane che soffre di disturbi psichici, ma è intelligentissimo e molto sensibile. Il suo amico immaginario è un enorme coniglio nero di nome Frank che gli preannuncia una notizia sconvolgente: la fine del mondo avverrà tra 28 giorni. Per via di un assurdo incidente, un aereo perde un motore che si schianta proprio sulla canera di Donnie, lasciandolo incolume per miracolo, il giovane capirà quanto sia importante essere vivi. Scoprirà l'amore e, armato di un misterioso libro, Donnie si ritroverà a viaggiare dentro le miriadi di cause che tengono unito l'universo, e, come se fosse dotato di un potere soprannaturale, potrà decidere se cambiare il corso del tempo e del destino....