Gli X Men sono individui mutanti dotati di un particolare gene che consente a ciascuno di loro di avere un potere speciale, ma inevitabilmente li condanna all'isolamento in un mondo che li ritiene diversi. Alcuni sono al servizio del bene sotto al guida del professor Xavier, mentre altri sono al servizio del perfido Magneto che ha dichiarato guerra al mondo.
Il gruppo degli X-Men è di nuovo insieme alla caccia di un mutante assassino che vuole attentare alla vita del Presidente, proprio mentre l'Accademia dei Mutanti è attaccata da ingenti forze militari. I mutanti, vivendo in una società che diffida di loro, subiscono ogni tipo di discriminazione, soprattutto dopo che un mutante con poteri eccezionali lancia un attacco letteralmente devastante. Contro di loro si scatena una protesta pubblica e viene ripristinato il Mutant Registraction Act.
Mr. Fantastic l'uomo di gomma, Sue la donna invisibile, Johnny la torcia umana e Ben l'uomo roccia. Insieme formano il gruppo dei Fantastici Quattro e il loro compito è quello di difendere il mondo dal terribile e crudele Dottor Doom. Il film, tratto dal celebre fumetto della Marvel, racconta la storia del gruppo dei quattro astronauti che, durante un viaggio nello spazio, viene esposto a potenti radiazioni grazie alle quali ognuno di loro acquista speciali superpoteri.
Matt Murdock da bambino perde la vista in un incidente ma in cambio acquista capacità sensoriali eccezionali. Avvocato di giorno e supereroe di notte, Daredevil difende gli abitanti di Hell's Kitchen dalle ingiustizie. Il supercriminale Kingpin decide di toglierlo di mezzo grazie a Bullseye. A complicare la storia la relazione nata tra Elektra e Devil. Più spigolosa e tagliente della versione cinematografica, questa versione integrale contiene oltre 30 minuti di scene inedite e una storia nella storia in cui Matt Murdock accetta di difendere un uomo non del tutto innocente, che è stato incastrato per omicidio.... Nella battaglia tra il Bene e il Male entra in campo una guerriera, Elektra, un'eroina forte e misteriosa, una sintesi letale di grazia e potenza. Dopo essersi ripresa da quelle che sembravano ferite mortali, Elektra ha rotto ogni legame con il mondo: oggi è una donna che vive solo per la sua prossima missione. Ma eventi imprevedibili la pongono di fronte ad una decisione che può mutare per sempre la sua esistenza, oppure distruggerla. Compagni di viaggio nella sua avventura sono Stick, un maestro di arti marziali non vedente, responsabile della miracolosa guarigione di Elektra, e Mark e Abby Miller, padre e figlia in fuga da La Mano, un potente sindacato del crimine i cui membri praticano l'oscura arte marziale del ninjitsu. Ispirato ai fumetti della Marvel Comics.