Impegnato a raccogliere fondi per le ricerche a sostegno di una teoria su una forma d'intelligenza evoluta nei Velociraptor, il professor Alan Grant, paleontologo di fama, riceve la visita di Paul Kirby, che si dichiara uomo d'affari, e di sua moglie Amanda: dopo qualche incertezza, si fa convincere ad accompagnare la coppia per un tour aereo ad Isla Sorna. L'isola, un tempo sede del SiteB della InGen, si è trasformata in territorio ideale per la crescita e lo sviluppo delle primitive creature portate in vita da John Hammond e meta obbligata per gli amanti del brivido e dell'avventura. Quando, dopo un brutto incidente, l'aereo precipita sull'isola e la spedizione si trova bloccata senza possibilità di fuga, Alan apprende il vero motivo del viaggio: Paul e Amanda, che in realtà sono separati, vogliono ritrovare il loro figlio Erik, precipitato mentre era in compagnia del nuovo fidanzato di Amanda. Il tentativo di ritrovare Erik va di pari passo con quello di individuare una via d'uscita. Mentre procede nella fitta boscaglia, il gruppo (in tutto sette persone) si trova ad affrontare terrificanti creature, la cui esistenza non era stata resa nota dalla InGen: lo Spinosauro, gigantesco predatore anfibio, e lo Pteranodattilo. Superate situazioni di grande paura (ma alcuni degli accompagnatori muoiono divorati dai dinosauri), Erik viene ritrovato. La gioia dura poco, fino a quando viene rapito da alcuni uccelloni rapaci. Arrivati sulla spiaggia, i superstiti sono circondati dagli animali: bisogna restituire loro le uova che Billy, l'assistente di Alan, aveva sottratto. Quindi salgono tutti su una barca e, per fronteggiare l'ultimo disperato assalto, Alan dal cellulare chiama Ellie, che era stata sua assistente. La telefonata va a buon fine, perchè di lì a poco sulla spiaggia arrivano mezzi militari e soldati. Tutti sono salvi. E Paul dice ad Amanda e al figlio: "Torniamo a casa".