I coraggiosi guerrieri guidati da Rayden e Liu Kang, già protagonisti del precedente film, si trovano a dover combattere a colpi di kung fu, con l'imperatore di Outworld, Shao Khan, che sta muovendo alla volta della terra per un' invasione totale.Toccherà ai nostri eroi la difesa dell'umanità intera. TRAMA LUNGA Una banda di combattenti senza paura ha sconfitto i malvagi signori della guerra provenienti da Outworld, nel corso di un torneo ai limiti fra la vita e la morte denominato Mortal Kombat. Così la Terra è salva ancora per una generazione. Ma proprio quando gli eroi si godono la loro vittoria, i portali che si affacciano su Outworld vengono distrutti da una gigantesca figura dal volto di morte che dichiara che la lotta è appena iniziata. Shao-Khan, imperatore di Outworld, non solo ha infranto le regole di Mortal Kombat, ma sta giungendo personalmente con i suoi plotoni di sterminio per eliminare tutti i nemici. Liu Kang, che guida la riscossa, dice che Shao-Khan è suo fratello e quindi tocca a lui il compito di fermarlo. Quando sono di fronte per affrontarsi a duello, ecco che Shao-Khan ritorna ad essere mortale. Il destino dell'universo è di nuovo affidato alle regole del Mortal Kombat, e la salvezza diventa possibile. Gli umani tornano sulla Terra. Rayden dice a Liu, a Sonia e agli altri di stare attenti perché loro ormai formano una famiglia.